1.本科知网查重参考文献查不查
不查的，我也是大四的，刚定稿，也是以知网为标准，我们发的查重文章是把封面参考文献、附录和致谢拿掉再去查的
2.知网查重，我提交的格式不对（把封面也提交了，目录不是自动生成的），会有重复的地方查不出来吗
封面那几个字对文章整体的重复率没有太大影响的
这个你不用担心的，知网查重的原理是把你的原有的word论文打碎成txt这种没有格式的纯文本文档，然后进行云端的匹配，也就是说，如果你做好了版式，知网也会自动的给你的版式毁掉的，然后去查重，因为有格式的文字是不能进行云端的一个匹配的。所以你放心好了。
3.论文查重复的时候 封面也要查么
亲 论文查重只是查正文 其他的不用
4.论文查重是只查正文吗，目录和参考文献查不查啊
这个要看你学校具体要求的，你学校要检测哪些就上传哪些，尽量和学校查重内容保持一致，这样检测的才一致。不过目录和参考文献在学校查重系统可以识别的，只要你的格式正确，系统可以自动剔除不算重复的。查重可以直接到图书馆查重，也可以到一些知网自助查重网站：学术不端网、PaperEasy、蚂蚁查重网等，全程自助安全！快速！
会查的。
目录是由正文里的标题产生的，查正文的时候会查标题；
参考文献重复一些是没问题的，不能重复太多，比如90%都一样就不行。
查重的学术不端检测理论上是查正文，不过，系统并不智能，同样的文章不同次检测结果也不同。有时候，论文封面的标准格式、页码、参考文献、致谢、个人简历、在学期间学术成果等页面也会被查重，计入重复率百分比。所以，学校还要求大家对查重结果做说明，说明这些是非正文，不涉及学术观点